Да, "строительная метафора" базиса и надстройки не годится. Метаформа "организма", в котором ткани и органы специализированы и выполняют жизненно важные функции. В данный момент наука хоть и придушена, в большей степени сохранила черты сообщества и внутренней системы информации. В принципе, эта часть общества имеет больше возможностей восстановить свою целостность и стать субъектом общественного сознания, чем совсем деклассированные общности. Но ведь никаких признаков этой самоорганизации и даже осознания своих главных функций в остатках научного сообщества не наблюдается. "Снизу" ничего не выходит, а "верхам" в их нынешнем формате это не надо.
Как вы видите создание "затравки" для кристаллизации? Собрать Второй съезд научной интеллигенции не удалось, а постоянные органы, учрежденные на первом съезде, не работают и не работали.