В оценке потерь имеются расхождения. Советские и российские источники не
сообщают о потерях среди гражданского населения, указывая, что, в отличие от
будапештских событий 1956 года, столь масштабное вторжение произошло почти
бескровно. Боевые действия практически не велись. Имели место отдельные
случаи нападения на военных, но в подавляющем большинстве жители
Чехословакии не оказали сопротивления. По современным данным, в ходе
вторжения было убито 108 и ранено более 500 граждан Чехословакии, в
подавляющем большинстве мирных жителей.[5][6] Только в первый день вторжения
было убито или смертельно ранено 58 человек, в том числе семь женщин и
восьмилетний ребёнок. Наибольшее число жертв среди мирных жителей было в
Праге в районе здания Чешского радио. Вероятно, значительная часть жертв
была незадокументирована. Так, свидетели сообщают о стрельбе советских
солдат по толпе пражан на Вацлавской площади 21 июня[уточнить] 1968 года, в
результате которой погибло и было ранено несколько человек, хотя данные об
этом инциденте не вошли в отчёты Чехословацкой службы безопасности.[7]
Многочисленны свидетельства о гибели мирных жителей, в том числе среди
несовершеннолетних и лиц пожилого возраста, в Праге, Либерце, Брно, Кошице,
Попраде и других городах Чехословакии в результате немотивированного
применения оружия советскими солдатами.[8] Известно также об обстреле здания
Национального музея советскими танками.
Всего с 21 августа по 20 сентября 1968 года боевые потери советских войск
составили 12 человек погибшими и 25 ранеными и травмированными. Небоевые
потери за этот же период - 84 погибших и умерших, 62 раненых и
травмированных. Также в результате катастрофы вертолёта в районе г. Теплице
погибли 2 советских корреспондента.[9]
