В качестве сугубо моей гипотезы я бы высказал такую идею.
Лопатки гидротурбины не просто воспринимают и преобразуют кинетическую энергию вращения воды, но и служат направляющей для потока. Т.е. изменяют его направление.
У ГА-2 были поворотные лопатки ротора. Если они сработали не синхронно с изменением потока воды через направляющий агрегат(у которого были неисправные заслонки), то часть импульса потока могла оказаться перенаправленной вверх. И тогда могло возникнуть дополнительное к статическому давление скоростного напора. В отличие от гидроудара оно не моментальное, а длительно действующее. И оно реально могло разгонять крышку вместе с ротором вверх.
Выход собственно ротора из своего места и прекращение гашения кинетической энергии воды электромагнитными силами в статоре означали, что скоростной поток натыкался на "стенку" из замедленного при более-менее нормальной работе гидроагрегата потока.
И опять-таки избыточный импульс потока перенаправлялся в единственно свободное пространство - вверх.