"Двуйка" Минобороны и "двуйка" Генштаба - разные структуры
В сборнике "Красноармейцы в польском плену в 1919-1922 г.г." на странице 239 приводится текст документа под названием "Распоряжение II отдела Минвоендела Польши II отделу Верховного командования ВП о необходимости обыска пленных красноармейцев от 17 июля 1920 г."
Из этого можно сделать вывод о том, что это были две отдельные структуры. (Польский Генштаб какой-то период времени назывался "Верховным командыванием ВП")