Поищите Dia и/или попробуйте из пакета OpenOffice - Draw (он есть практически в любом дистрибутиве линукс). Как я понял, во всех этих программах главное наличие доп. библиотек шаблонов (которые определяют внешний вид рисуемых схем).
Сам я видел только OpenOffice Draw но не пользовался.