Создан вуз был 30 ноября 1923 г. как Высшая пограничная школа для подготовки командиров погранохраны среднего звена управления, сочетающих в одном лице функции войскового начальника и руководителя оперативной работы. Через 23 года, в августе 1946-го, школа меняет свой статус и становится Военным институтом МВД, который осуществлял подготовку кадров для пограничных, внутренних, железнодорожных войск и войск ПВО. С 1960 г. начинается череда бесконечных преобразований. Вуз становился то факультетом академии, то курсами повышения квалификации, то вновь институтом, то академией, то снова институтом. Пока, наконец, 9 апреля 1994 г., на его базе по президентскому указу не возникла Академия пограничных войск.
В феврале 1936 г. Высшая пограничная школа была награждена орденом Ленина. С началом Великой Отечественной войны из ее стен отправились на фронт 610 командиров, которые возглавили соединения и части Красной Армии. Являясь оперативным резервом войск НКВД и Московского гарнизона, личный состав школы активно участвовал в обороне столицы. И уже в декабре 1943 г. на Боевом знамени учреждения красовался орден Красного Знамени.
>В феврале 1936 г. Высшая пограничная школа была награждена орденом Ленина. С началом Великой Отечественной войны из ее стен отправились на фронт 610 командиров, которые возглавили соединения и части Красной Армии. Являясь оперативным резервом войск НКВД и Московского гарнизона, личный состав школы активно участвовал в обороне столицы. И уже в декабре 1943 г. на Боевом знамени учреждения красовался орден Красного Знамени.
В 1939 году школа называлась - Центральная школа усовершенствования комсостава войск НКВД,
В 1941 году - Высшая школа войск НКВД.