На сколько-нибудь обозримый промежуток времени вижу только одну проблему - коллапс именно российских научных коллективов. Работы по рецензированию статей - немаловажная составляющая научного процесса. Потеря этого вида деятельности из-за ухода статей в международные журналы - удар наотмашь.
А так, в принципе, перспективы самоизоляции российской науки не просматриваются, просматривается противоположная тенденция. Ограниченные(финансово - иметь подписку на несколько международных журналов накладно, а отечественные теряют уровень) возможности для чтения лучших научных результатов работающими в России учеными становятся внешним железным занавесом.
Бесплатный доступ через Интернет к необходимым журналам становится привилегией непрерывно сокращающегося общего числа сотрудников ведущих НИИ. Для заинтересованных в доступной научной информации непрофильных организаций такая возможность становится серьезной организационной и финансовой проблемой.