Из Положения о Федеральном агентстве научных организаций (по состоянию на 23 октября 2013)
5.3.1. осуществляет в порядке и пределах, определенных федеральными законами, актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации функции и полномочия учредителя организаций, подведомственных Федеральному агентству научных организаций, а также функции и полномочия собственника федерального имущества, закрепленного за Федеральным агентством научных организаций и подведомственными ему организациями;
5.3.2. утверждает программы развития научных организаций, подведомственных Федеральному агентству научных организаций;
5.3.3. утверждает с учетом предложений РАН государственные задания на проведение фундаментальных научных исследований и поисковых научных исследований научными организациями, созданными в форме бюджетных и автономных учреждений, подведомственными Федеральному агентству научных организаций;
5.3.4. проводит оценку эффективности деятельности организаций, подведомственных Федеральному агентству научных организаций;
5.3.5. осуществляет экономический анализ деятельности подведомственных государственных унитарных предприятий и утверждает экономические показатели их деятельности, проводит в организациях, подведомственных Федеральному агентству научных организаций, проверки финансово-хозяйственной деятельности и использования имущественного комплекса;
5.3.6. закрепляет за организациями, подведомственными Федеральному агентству научных организаций, федеральное имущество и производит в установленном порядке правомерное изъятие этого имущества;
5.3.7. осуществляет в порядке и пределах, определенных федеральными законами, актами Президента Российской Федерации и Правительства Российской Федерации, принятие в федеральную собственность имущества, созданного за счет средств федерального бюджета в рамках реализации программ проведения фундаментальных, поисковых и прикладных научных исследований, в том числе в рамках федеральной адресной инвестиционной программы, а также приобретенного организациями, подведомственными Федеральному агентству научных организаций, за счет иных, не запрещенных законодательством Российской Федерации, источников, осуществляет организацию оценки федерального имущества, закрепленного за организациями, подведомственными Федеральному агентству научных организаций;
5.3.8. представляет в органы, осуществляющие государственную регистрацию прав на недвижимое имущество и сделок с ним, документы на государственную регистрацию права собственности Российской Федерации и иных вещных прав на недвижимое имущество, закрепленное за Федеральным агентством научных организаций и за подведомственными ему организациями;
5.4. осуществляет контроль за деятельностью территориальных органов Федерального агентства научных организаций;
5.5. обращается в суды с исками и в правоохранительные органы с заявлениями от имени Российской Федерации в защиту имущественных и иных прав и законных интересов Российской Федерации по вопросам управления и распоряжения федеральным имуществом, закрепленным за Федеральным агентством научных организаций и за подведомственными ему организациями;
5.6. в установленном законодательством Российской Федерации порядке осуществляет функции государственного заказчика, связанные с осуществлением закупки товаров, работ, услуг, в том числе заключает государственные контракты, а также иные гражданско-правовые договоры на поставки товаров, выполнение работ, оказание услуг, проведение научно-исследовательских, опытно-конструкторских и технологических работ для обеспечения нужд Российской Федерации;
5.7. осуществляет функции участника и исполнителя государственных программ Российской Федерации, государственного заказчика федеральной адресной инвестиционной программы в сфере деятельности Федерального агентства научных организаций;
5.8. взаимодействует в установленном порядке с государственными органами иностранных государств, международными, иностранными организациями;
5.9. организует конгрессы, конференции, семинары, выставки и другие мероприятия в установленной сфере деятельности;
5.10. обеспечивает в пределах своей компетенции защиту сведений, составляющих государственную, служебную и иную охраняемую законом тайну, а также координацию деятельности организаций, подведомственных Федеральному агентству научных организаций, по защите таких сведений;
