Предполагается, что милиция имеет дело с мирными гражданами, в отношении которых действует презумпция невиновности. Как говориться, "пока не доказано обратное" (или гражданин явно не докажет преступные намерения, например, достав пистолет).
Военный имеет дело с противником (а разведгруппа еще и на территории противника), и доказательства вины противника и наличия угрозы со стороны противника ему не требуются. В этом и есть отличие мирной ситуации от военной. В Чечне власть запутывает ситуацию сознательно - официально "мир", а на деле - боевая обстановка. А если "мир", то военным там вообще делать нечего. Пусть милиция со всем разбирается. В отношении мирных граждан в мирное время у военных вообще нет никаких законных полномочий. Даже документы проверить или задержать кого-либо они не имеют права.