Не уверен, что не было приказов о таком обучении, но...
>В те времена, когда "юнкер" не было равнозначно "курсанту" ВУ, в полках не было школ, где юнкеров все-таки готовили к присвоению офицерского чина?
...по всей видимости, теоретической подготовкой пренебрегали, только практически знакомя с обязанностями службы.
Обнаружив крайне низкую подготовку подпрапорщиков, Николай, тогда ещё не Первый, приказал сформировать Школу Гвардейских Подпрапорщиков, так что подпрапорщики гвардии стали получать специальные знания.
"В школе преподавались уставы, тактика, полевая фортификация и артиллерия, глазомерная съемка и ситуационное черчение, военное и гражданское законодательство, а также история и география."
Армейские, видимо, оставались на том же уровне.
Затем Школа Гвардейских Подпрапорщиков была преобразована в Николаевское кавалерийское училище, и вообще стали отказываться от подготовки офицеров в полках, а подпрапорщик стало званием для выпускника юнкерского училища, выпущенного не первым разрядом (и получавшего офицерский чин после выслуги в полку). Затем юнкерские училища были преобразованы в военные (до того военные училища выпускали офицеров, а юнкерские только лучших офицерами, и в военные училища принимали после кадетских корпусов), и подпрапорщик стало высшим унтер-офицерским званием, скорее даже почётным отличием.