• 1972—1977 гг. — студент Красноярского политехнического института
• 1977—1978 гг. — мастер треста «Промхимстрой», г. Красноярск
• 1978—1979 гг. — мастер, начальник участка треста «Тувинстрой», г. Кызыл (столица Тувинской АССР)
• 1979—1984 гг. — старший прораб, главный инженер, начальник строительного треста «Ачинскалюминийстрой», г. Ачинск
• 1984—1985 гг. — заместитель управляющего трестом «Саяналюминстрой», г. Саяногорск
• 1985—1986 гг. — управляющий трестом «Саянтяжстрой», г. Абакан
• 1986—1988 гг. — управляющий трестом «Абаканвагонстрой», г. Абакан
• 1988—1989 гг. — второй секретарь Абаканского ГК КПСС, г. Абакан
• 1989—1990 гг. — инспектор Красноярского крайкома КПСС, г. Красноярск
• 1990—1991 гг. — заместитель Председателя Государственного комитета РСФСР по архитектуре и строительству, г. Москва
• 1991 г. — председатель Российского корпуса спасателей, г. Москва
• 1991 г. — председатель Государственного комитета РСФСР по чрезвычайным ситуациям, г. Москва
• 1991—1994 гг. — председатель Государственного комитета Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий
• 1992 г. — назначен заместителем главы временной администрации на территории Северной Осетии и Ингушетии во время осетино-ингушского конфликта
• в ночь с 3-го на 4-е октября 1993 по просьбе Егора Гайдара выделил для него 1000 автоматов с боезапасом из подведомственной ему системы гражданской обороны
• 1993—2003 гг. — председатель Национальной комиссии Российской Федерации по проведению международного десятилетия ООН по уменьшению опасности стихийных бедствий
• 1994—2012 гг. — Министр Российской Федерации по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий (Одновременно, с 10 января 2000 г. по 7 мая 2000 г. — заместитель Председателя Правительства Российской Федерации.)
• 1996 год — куратор избирательной кампании Президента Российской Федерации в субъектах Российской Федерации
• С 1996 г. — член Совета Безопасности Российской Федерации
• В 2000 году возглавил партию «Единство», которая позже вместе с партиями «Отечество» (Юрий Лужков) и «Вся Россия» (Минтимер Шаймиев) была преобразована в партию «Единая Россия».
• С 2001 г. — член Морской коллегии при Правительстве Российской Федерации
• С ноября 2009 года — президент Русского географического общества.
• До 30 июня 2011 года был председателем совета директоров федерального сетевого оператора в сфере навигационной деятельности «НИС ГЛОНАСС».
• 4 апреля 2012 года предложен Единой Россией на пост губернатора Московской области.
• 5 апреля 2012 года кандидатура Шойгу на пост губернатора Московской области единогласно поддержана Мособлдумой.
• 11 мая 2012 года состоялась инаугурация Шойгу, и он официально стал губернатором Московской области
• 6 ноября 2012 года назначен министром обороны Российской Федерации вместо отправленного в отставку Анатолия Сердюкова. По словам пресс-секретаря председателя правительства Натальи Тимаковой, Шойгу к назначению министром обороны рекомендовал Дмитрий Медведев[18].