Снят с работы Главного военного прокурора в июле 1950 года с партийным строгачом с занесением и запретом работать в органах юстиции. Тут же уволился из армии в отставку по состоянию здоровья.
Формальной причиной было то, что Афанасьев добился снижения до фактически отбытого срока некоему капитану МВД, в пьяном виде учинившему стрельбу в публичном месте и попавшему в портрет Сталина. Вместо предполагаемого по умолчанию терроризма, каким-то чудесным образом вменили хулиганку, дали трёшечку, но даже этого отбыть, увы, никак не получилось. А потом добрые люди стукнули в КПК... Вся эта история подробно описана в мемуарах Афанасьева, опубликованных в книге Ушакова, Стукалова "Фронт военных прокуроров".
Там Афанасьев, конечно, описывает себя сущим Дартаньяном - мол, пожалел мальчишку, но из фактуры напрашивается предположение, что за хорошего человека попросили хорошие люди из МВД.
