Военным, прибывающим на территорию другого государства по межгосударственным договоренностям, загранпаспорт не нужен. Те же военные моряки при заходе в иностранные порты, или сухопутные военные, прибывающие на международные учения, обходятся без загранпаспортов. Не знаю, как там сейчас в Сирии, но подозреваю, что и там вряд-и загранпаспорта военным оформляют. Ну а таможня и погранконтроль - это уже смотря как организуют в каждом конкретном случае.
