>В основном, вроде, при Петре, но утверждается, что последние следы крепости исчезли только во 2-й половине XX века, т.е. после войны.
ИМХО, Петр всем жителям Ниена повелел переселяться ниже по течению (навстречу наводнениям), в новооснованный Петербург - любил он такие методы, потом ещё по новому городу жителей гонял, переселял с Амиралтейской стороны на Васильевский. А Ниен был именно упразднён как город и "демонтирован", хотя, наверное, какие-то земляные работы ("шанцы") ещё долго сохранялись
