От Социал
К Сысой
Дата 08.03.2002 21:00:28
Рубрики Россия-СССР; Крах СССР; История; Образы будущего; Общинность; ...

Re: Воспроизводимостью экспериментальных...

Добрый вечер.

>>У меня вызывают большие сомнения разговоры о точности генетики,
>>поскольку до сих пор у генетиков нет надежного способа изучать ДНК.
>Что значит "надежный способ изучать ДНК"? Что вы имеете в виду?
Вы знаете как выполняют тест на ДНК?
И что значит понятие "расшифровали геном"?
В свое время я интересовался этими вопросами и регулярно отслеживаю ситуацию в этой области.
Так вот, "идентичность" двух ДНК определяется с огромными допущениями, и строго говоря "идентичные" ДНК могут быть совсем не идентичны.

Если не вдаваться в технические и математические подробности, то сходство определяется по совпадениям или не совпадениям отдельных фрагментов. Все равно, что сравнивать две строки на эквивалентность, сравнивая места и частоту вхождения буквы "Н"
Строки
1:сосНа
2:весНа,
Будут идентичны (с точки зрения "ДНК анализа").
Вот такая там точность...
От Сысой
К Социал (08.03.2002 21:00:28)
Дата 09.03.2002 01:41:46

Не надо вводить в заблуждение ...

Здравствуйте!

>Вы знаете как выполняют тест на ДНК?

Дружище, давайте избавляться от мухинизма. Не надо такой лажи "тест на ДНК". Тестов существует миллионы, что вы имеете в виду - непонятно. Даете какой-то мутный вопрос, а затем с важным видом показываете свой дилетантизм.

>И что значит понятие "расшифровали геном"?

Объясняю на пальцах. "Расшифровали геном" - это из газет низкого пошиба. Фирмы и институты, этим занимающиеся, сообщили лишь о определении последовательности нуклеотидов в "типичном" человеческом геноме, да и то лишь на 90%. Не надо опять этой лажи из газет как примеров деятельности ученых. Тщательнее надо ... Вам ссылку на оригинал давать? Или сами пороетесь?

>В свое время я интересовался этими вопросами и регулярно отслеживаю ситуацию в этой области.

Отслеживать не всегда означает понимать.

>Так вот, "идентичность" двух ДНК определяется с огромными допущениями, и строго говоря "идентичные" ДНК могут быть совсем не идентичны.

А вот врать не надо, здесь этого не любят. Идентичны в научной (не газетной) статье означает именно идентичны, причем всегда опредлеяются регионы молекулы, которые идентичны (т.е.100%), а которые неидентичны или подобны. Все ходы записаны - в смысле все допущения оговариваются и трактуются в сомнительных случаях против предлагаемой гипотезы.

>Если не вдаваться в технические и математические подробности, то сходство определяется по совпадениям или не совпадениям отдельных фрагментов. Все равно, что сравнивать две строки на эквивалентность, сравнивая места и частоту вхождения буквы "Н"
>Строки
>1:сосНа
>2:весНа,
>Будут идентичны (с точки зрения "ДНК анализа").
>Вот такая там точность...

Грубо работаете, товарищ ... Приведенный вами пример идет под названием "подобны", а не идентичны. Читайте - и обрящете ...

С уважением
От Александр
К Социал (08.03.2002 21:00:28)
Дата 08.03.2002 22:07:42

Re: Воспроизводимостью экспериментальных...

>Если не вдаваться в технические и математические подробности, то сходство определяется по совпадениям или не совпадениям отдельных фрагментов. Все равно, что сравнивать две строки на эквивалентность, сравнивая места и частоту вхождения буквы "Н"
>Строки
>1:сосНа
>2:весНа,
>Будут идентичны (с точки зрения "ДНК анализа").
>Вот такая там точность...

А если вдаться то строки можно прочитать полностью. Например по Сенгеру. Проводят 4 реакции синтеза ДНК, начинающиеся с одного и того же места. Место задается праймером - одноцепочечной ДНК, длиной около 20 нуклеотидов. (Вероятность того что праймер будет эффективно прилипать не туда 4^-20 Кроме того, это сразу видно по грязной реакции и используют другой праймер.) В каждую из реакций помимо обычных нуклеотидов добавлены дидезокси нуклеотиды, которые останавливают рост новой молекулы ДНК. В одной реакции рост останавливается на буквах "А", в другой на буквах "G", в третьей на буквах "С", в четвертой на буквах "T". Продукт из каждой реакции метится флюоресчентным красителем своего цвета, Например "А"-зелененьким, "С" красненьким и т.д. Потом все 4 реакщии гонят по акриламидному гелю, который разделяет их по размеру и считывают какой цвет проходит через финишную прямую. Если первая буква в ДНК была "А" то самым первым к финишу придет продукт из той реакции где цепи обрывались по букве "А", и который покрашен зеленым. Ведь он самый короткий, идет быстрее всех. Видят на финише зеленый - пишут "А". Если следующая буква "С" то вторым к финишу придет продукт той реакции, которую останавливали по букве "С". Там буква "А" считалась без проблем, а цепь оборвалась на букве "С". Тоесть она на одну букву длиннее и к финишу приходит второй. Видят желтый - пигут "С". И т.д. Хорошие аппараты могут больше тысячи букв за раз прочитать. Для большей надежности читают ту же ДНК и в противоположном направлении, но это уже для большинства применений оверкил.

Есть, разумеется, методы для менее точного анализа - маппирования. Например, берут участок ДНК, который у разных людей часто различается. Нарабатывают его побольше и смотрят какого он размера. Скажем, если у трети человечества он 1000 пар, у четверти 1200, и у остатних 5/12 600 пар, да таких варьирующих кусков смотрят сотню-другую то определить твоя это ДНК или нет можно со сколь угодно высокой надежностью. (Зависит от числа просмотренных кусков и их вариабильности в популяции). Искать различия по буквам в таких случаях совсем не обязательно.

Каждый кусок нарабатываются с помощью пары праймеров, длиной около 30 нуклеотидов. Вероятнось неправильного прилипания 4^-30. Для двух праймеров, да на том же расстоянии друг от друга 4^-60