1. Необходимость статистической проверки теорий никто не отменял. Если теория не соответствует эмпирике, то эта теория ошибочна, и никакие оговорки про "прочие равные" и логичность тут не помогут. Не можете описать реальный результат - в топку Ваши построения.
2. Метод "после - значит по причине" является основным в статистике. Поправлюсь, статистика не устанавливает причинность. Но разбирается с корреляциями. Если между ж.дорогами и положением крестьян есть отрицательная корреляция (буде у Вас достаточное количество наблюдений для таких утверждений), это говорит о том, что между ж.д. и бедственным положением имеется определённая связь. Таким образом утверждать, что ж.д. ведут к улучшению положения данной группы населения нельзя.
3. Ваша критика метода "после - значит по причине" ошибочна.
Действительно, если А, то Б.
Но если нет Б, то нет А. Всё в рамках логики.
Поэтому если модель утверждает, что положение крестьян улучшится после постройки ж.д., а оно ухудшилась, то, согласно логике, модель не верна!
4. Пора Вам начать работать с эмпририкой и анализом конкретных ситуаций. Сколько придётся этого ждать? Год? Два?
