И та и другая модель являются эволюционистскими (что Вам конечно шибко не нравиться), однако они различны по своим предсказаниям, набору объясняемых фактов и т.д. Например, «линейная» дарвиновская эволюция слишком медленна чтобы уложиться даже в 6 млрд. лет существования планеты Земля, не объясняет периодических всплесков эволюционной активности, не имеет представлений о биохимической эволюции, предшествовавшей появлению клетки и т.д. Все эти различия носят такой же методологический характер как и отличие классической механики от нелинейной термодинамики Пригожина.