Католические клерики были представлены в нацистском движении практически с самого начала. Патер Stempfle редактировал Mein Kampf. В 20-х из НДСАП изгонялись деятели с антицерковными тенденциями. Правда, после 1933 наци несколько ущемили католиков в плане ликвидации церковных школ, католических общественных организаци, не говоря уж о политических партиях (партии Центра и Баварской народной). Но это не было специально направлено против католицизма - просто приводили всех к одному знаменателю.
Австрийская католическая церковь поддержала аншлюсс в 1938 и прозывала на референдуме голосовать за наци.
Ну и т.п.
Однако традиционно сервильная Евангелическая церковь прогибалась перед режимом ещё охотнее.