От SerP-M
К Begletz
Дата 19.07.2006 04:23:34
Рубрики Современность; Спецслужбы; Локальные конфликты;

Я имел в виду именно такой вариант. (+)

Приветствую!

Сравнивать "с самим собой" - это тривиально, и прокол может быть в этом случае только из-за мозаицизма.

А я писал как раз с упором на сравнение с родственниками. Тут этак дюжина микросателлитных локусов плюс рассчет статистики дают ОДНОЗНАЧНЫЙ резултат.
К примеру, гипотетический SNP1 имеет частоту встречаемости в популяции 0,2; SNP2 - 0,1; SNP3 - 0,6; SNP4 - 0,02; SNP5 - 0,3; SNP6 - 0,4; SNP7 - 0,05; SNP8 - 0,7; SNP9 - 0,03; SNP10 - 0,25. Таким образом, второй идентичный субьект в человеческой популяции может встретиться с частотой 0,00000000756 (получаем путем перемножения вероятностей). Т.е. вероятность меньше, чем один из 100 миллионов...
Аналогично рассчитывается отцовство/материнство/братство-сестринство. Считают количество совпадающий аллелей у росдственников, а потом рассчиывают, какова вероятность этого, если они родственники, и какова - если сочетание случайное. Т.к., аллелей обычно берется больше 10, то цифры там запредельные....

Сергей М.
От Begletz
К SerP-M (19.07.2006 04:23:34)
Дата 19.07.2006 05:52:15

Re: Я имел...

>Приветствую!

>Сравнивать "с самим собой" - это тривиально, и прокол может быть в этом случае только из-за мозаицизма.

>А я писал как раз с упором на сравнение с родственниками. Тут этак дюжина микросателлитных локусов плюс рассчет статистики дают ОДНОЗНАЧНЫЙ резултат.
>К примеру, гипотетический SNP1 имеет частоту встречаемости в популяции 0,2; SNP2 - 0,1; SNP3 - 0,6; SNP4 - 0,02; SNP5 - 0,3; SNP6 - 0,4; SNP7 - 0,05; SNP8 - 0,7; SNP9 - 0,03; SNP10 - 0,25. Таким образом, второй идентичный субьект в человеческой популяции может встретиться с частотой 0,00000000756 (получаем путем перемножения вероятностей). Т.е. вероятность меньше, чем один из 100 миллионов...
>Аналогично рассчитывается отцовство/материнство/братство-сестринство. Считают количество совпадающий аллелей у росдственников, а потом рассчиывают, какова вероятность этого, если они родственники, и какова - если сочетание случайное. Т.к., аллелей обычно берется больше 10, то цифры там запредельные....

Ващета, насколько мне известно, СНиПы в суде еще никто не впаривал, только повторы пока идут.

Как раз такой хреновиной сейчас и занимаюсь. Проблема оказалась в том, что если берешь СНиПы с высокой частотой, то слишком много гетерозигот, а если с низкой, то слишком много доминантной аллели. Кароче, я прогнал 10 независимых образцов, 5М+5Ж, по 12 высокочастотным СНиПам, и оказалось, что из 5х5х8=200 возможных комбинаций отец+мать+ребенок целых 8 оказались разрешенными, хотя мой расчет вероятности предсказывал значительно меньший шанс (1 из 1000). Один СНиП оказался ваще бесполезен, т к в этой выборке было 9 гетерозигот (!).
От SerP-M
К Begletz (19.07.2006 05:52:15)
Дата 19.07.2006 06:07:51

Не, ашипка с аббревиатурой. Я говорил про Short Tandem Repeats (+)

Приветствую!
А со снипами у Вас тоже интересно получается! Не пробовали прогнать ЭсТэЭры параллельно? Где разрешение больше? А снипы на какой машине гоняете?
Сергей М.
От Begletz
К SerP-M (19.07.2006 06:07:51)
Дата 19.07.2006 06:22:48

Ловко вы меня раскрутили !:-))

Впрочем, кто меня за язык тянул? :-)

>Приветствую!
>А со снипами у Вас тоже интересно получается! Не пробовали прогнать ЭсТэЭры параллельно? Где разрешение больше? А снипы на какой машине гоняете?

У СТРов больше (при равном числе маркеров), но они существенно дороже, потому и возникает ниша для продукта.

Технические детали разглашать не могу, т к коммерческая тайна :-))
От SerP-M
К Begletz (19.07.2006 06:22:48)
Дата 19.07.2006 06:38:19

Не дергайтесь - всё путем! :)))) (-)
От Eugene
К Begletz (19.07.2006 05:52:15)
Дата 19.07.2006 06:02:25

Я фигею, дорогая редакция...

Натужно вспоминая остатки знаний по биологии, пытаюсь проследить нить беседы. В общем понял, что шанс на однозначное определение родства достаточно велик. Так? ;)

С уважением, Евгений.
От SerP-M
К Eugene (19.07.2006 06:02:25)
Дата 19.07.2006 06:17:41

Да. А что касается Басая, то ...(+)

Приветствую!
... достаочно либо 100%-но аттрибутированного образца его крови/тканей (если где в Делах завалялось), либо одного прямого родственника. Причем, мертвые родственники тоже годятся (если тела 100%-но опознанные). А если будут образцы от друх прямых родственников (родителей или детей - без разницы), то будет иметь уже 200%-ную аттрибутацию!
:)))
Сергей М.