Ключевое слово - не "меласса", а "подводная лодка". Нет никаких оснований полагать, что ей мстили за потопленные отходы сахарного производства; скорее всего она пересекла этой диверсией оживленную каботажную трассу, возникла необходимость срочно утопить наглую п/л и восстановить сообщение.
в это же время там не одна она была. Другие лодки топили танкера и числом поболее, и тоннажем. С нефтью. При этом Блэйр делает акцент на то обстоятельство, что именно после потопления этого судна был дан приказ "найти и уничтожить" лодку.