Объяснение такого кол-во (не считая утраченных и спрятанных) это в
разном хранении знамён. В РККА знамя было при штабе постоянно, у немцев знамёна хранились в местах постоянной дислокации. У генералов были только личные штандарты и флажки ОЗ на машину.
То что кинули к мавзолею Ленина, немного вводит в недоумение, много знамён и штандартов не имели к ВОВ и 2МВ никакого отношения, видать было скудно с трофейными знамёнами (причину смотри выше).