Периодически доходя до ликвидации отдельного управления ВМФ вообще (как в 1920-е годы) - потому что видели, что бабла на флот тратится изрядно, а со вписанием оного в общую оборону страны дело плохо.
И как флотских не подчиняй и не нагинай - все равно отдельную войну вели. См. ту же ВОВ, где флоты были вообще в подчинении приморских фронтов. Что это изменило? По сути ничего. Содействие армии выдавливалось чуть ли не с уровня Ставки и сплошь и рядом делалось флотскими "на отъебись".