Фонарь там хитрый, переплет пластиковый и на ЭПР не влияет. А вот на Су-57 фонарь состоит из 2х частей и создается щель которая как раз и влияет на ЭПР.
На счет сопла, для Ф-35 самого по себе самолета максимально унифицированного - компромисс.
А вот для Т-50 обещали как и плоское сопло, так и беспереплетный фонарь.